江戸時代の天才・平賀源内は、「エレキテル」の発明や「戯作」執筆など、ジャンルを問わず奔放な才気を開花させる一方、当時の社会からは「異端」「奇人」として扱われました。その一代記を描いたこの喜劇には歌に、踊り、これでもかという言葉遊びなど満載の笑いとともに、作者のシンパシーを込めたインテリ批判が内在されています。ドラマは“表”と“裏”に二分された“源内”の喜劇的合戦によって展開してゆきます。
“表の源内”にはコクーン初登場、今年は舞台のロンドン公演も決定し、映画・ドラマでも充実した演技を魅せる<上川隆也>、“裏の源内には”ＴＶでの活躍も目覚しく、蜷川作品には欠くことのできない<勝村政信>。さらに、映画での世界進出宣言でますます輝きを増す<高岡早紀>、舞台出演で新たな魅力を発揮している<豊原功補>、確かな演技力と個性の<大石継太>、<立石凉子>、<六平直政>といった豪華かつ頼もしい顔ぶれが集結。
そして、このたび、蜷川作品初参加となる<篠原ともえ>、映画「クローズ ZERO」出演でブレイク中の<高橋務>の出演が決定！個性的・魅力的なキャストを得、蜷川幸雄が井上ひさしの伝説的コメディー音楽劇に、いかに挑むか！？どうぞご期待ください！！

時は享保十四年、貧しい足軽の家に生まれた四方吉は、四国随一の神童と呼ばれる美少年に成長し、松平藩の若君･頼恭の遊び・勉学の相手を務めるようになる。成人した四方吉は平賀源内と改名し、官費で長崎に留学し、阿蘭陀語や医学を学ぶ。そこで密輸で捕らえられた、遊女・花扇と出会う。
その後、本草学を究めるために江戸へ留学し、日本初の物産会をひらく資金繰りのために三井高光のもとを訪れ、鳥山検校のめかけ青茶婆（じつは花扇）と再会する。若手第一の本草学者となった源内は、立身出世を狙い幕府に士官するために高松藩辞任願いをする。面白くなく思った頼恭は、辞任を受託するとともに他藩への仕官を禁じてしまう。出世の道を断たれた源内は蟄居の身となりながらも、新たな開発・発明を続ける。
しかしそれは民衆の生活には届かず、やがて江戸中から"山師"と呼ばれるようになり・・・。